Είναι απίστευτο πόσες πολλές ιστορίες υπάρχουν για το όνομά μας:

Κατά τον Στέφ. Ξανθουδίδη, (Χάνδαξ – Ηράκλειον, σ. 28)  πρόκειται για βυζαντινό επώνυμο Φουρφουράς, γνωστού βυζαντινού οίκου.

Ο Ρεθεμνιώτης δάσκαλος Εμ. Λαμπρινάκης αναφέρει στo βιβλίo του (Γεωγραφία της Κρήτης, 1890, σ. 107): Φουρφουράς (φούρο) κώμη μεγάλη και ληστρική το πάλαι, όθεν το όνομα. Εννοεί το λατιν. ρήμα furor – fyrtatus sum-ari πoυ σημαίνει κλέπτω.

Πιθανή, πάντως, και η εξέλιξη σε Φουρφουράς του αρχ. πορφυρεύς= ο «ψαράς πορφυρών οστράκων», κατά τον P. Faure. Φουρφουράς< βαπτ. Πορφυράς, Πόρφυρας < Πορφύριος < πορφυρούς. Για την αφομοιωτική εξέλιξη π>φ πβ. κύρ. όνομα Φαρφουρή<Πορφυρή, Πορφυρία.

Υπάρχουν και αυτοί που υποστηρίζουν ότι το χωριό πήρε τ’ όνομα του από τους δυνατούς ανέμους που φυσούν συνήθως στην περιοχή.

Άλλοι πάλι λένε ότι τ’ όνομα του δόθηκε από έναν Ενετό αξιωματικό της οικογένειας Φουρφούρα.

Μια άλλη εκδοχή θέλει να παίρνει τ’ όνομά του, από το επώνυμο του πρώτου κατοίκου που ήταν κυνηγός.

Κάποιοι τέλος υποστηρίζουν ότι η ονομασία του οφείλεται στη λέξη φρούριο-Φουρφουράς, γιατί βρίσκεται πάνω σε απόκρημνους βράχους. Ερείπια από ένα τέτοιο φρούριο βρίσκονται στο ύψωμα πριν τον ναό της Παναγίας στην θέση Μουρτσέ, του 14^ου αιώνα.